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12月22日，記者從海南大學(xué)獲悉，該校陳飛教授與中國科學(xué)院羅鳴研究員領(lǐng)銜的研究團(tuán)隊(duì)，成功搭建面向觀賞開花植物的綜合多組學(xué)數(shù)據(jù)——花卉大數(shù)據(jù)平臺。該平臺為花卉研究人員提供便捷友好的一站式服務(wù)，可顯著提升相關(guān)研究的效率與廣度。

花在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)、食品加工、藥物提取等領(lǐng)域發(fā)揮著不可或缺的作用。因此，系統(tǒng)性解析花器官的發(fā)育調(diào)控機(jī)制，既是植物學(xué)研究的基礎(chǔ)前沿方向，也對農(nóng)業(yè)、食品及醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展具有重大應(yīng)用價值。然而在傳統(tǒng)研究模式下，育種家與科研人員探究開花調(diào)控基因時，往往需要耗費(fèi)大量精力預(yù)處理參考基因組、基因注釋文件及多個獨(dú)立轉(zhuǎn)錄組原始測序數(shù)據(jù)集，繁瑣的前期工作嚴(yán)重限制了研究推進(jìn)的效率與覆蓋的廣度。

針對這一行業(yè)痛點(diǎn)，研究團(tuán)隊(duì)打造的花卉大數(shù)據(jù)平臺實(shí)現(xiàn)了多維度數(shù)據(jù)的整合與標(biāo)準(zhǔn)化處理。平臺匯聚58個觀賞植物物種的62個高質(zhì)量基因組，囊括百合、蘭科、芍藥、梅、月季、三角梅、菊花等具有全球重要性的花卉品類；收納超過258萬個基因的注釋信息，以及8700多種已鑒定代謝物的相關(guān)數(shù)據(jù)，為多組學(xué)研究與分子育種工作筑牢數(shù)據(jù)根基。值得一提的是，平臺內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)均完成從原始序列質(zhì)控、比對到表達(dá)定量的全套標(biāo)準(zhǔn)化流程，形成可直接用于比較分析的高質(zhì)量數(shù)據(jù)集。

該平臺還具備強(qiáng)大的便捷化分析功能。研究人員無需編寫代碼，即可直觀探索基因功能；若需進(jìn)一步挖掘基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，只需一鍵啟動共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析，系統(tǒng)便能自動生成信息豐富的環(huán)形圖譜，清晰呈現(xiàn)所有正、負(fù)相關(guān)基因，助力研究者快速鎖定潛在功能模塊。

研究團(tuán)隊(duì)表示，這一成果打破了專業(yè)生信背景的門檻限制，讓不具備相關(guān)技術(shù)基礎(chǔ)的用戶，也能獨(dú)立、便捷地利用多組學(xué)數(shù)據(jù)開展深度數(shù)據(jù)挖掘與創(chuàng)新性研究。